Folding@Home: Windows vs Linux

quwy · Регистрация: 13.02.2013

Author24 — интернет-сервис помощи студентам

Я вскользь писал о сабже в холиварную тему, однако тамошних линуксоидов вопрос не заинтересовал совершенно, но проблему надо решать.

Для начала, Folding@Home -- это бесплатная добровольная сеть распределенных вычислений (ботнет, если хотите), организованная Стенфордским Университетом. Самая мощная из всех подобных проектов на данный момент. Мощность сети используется для моделирования свертывания молекул белков, что в перспективе позволит понять причины возникновения и найти способы лечения целого ряда болезней. От диабета до рака. Работа клиента ведется на наинизшем приоритете, памяти он потребляет мало, поэтому на производительность компьютера его работа никак не влияет. С помощью сторонних программ можно запускать клиент только ночью, или при блокировке рабочего стола.

В идеале участие в сети крайне простое: скачал инсталлятор, установил, и через пару минут твоя машина -- часть суперкомпьютера, работающего на благо человечества. В среде Windows это именно так и есть: на четырех доступных мне windows-компьютерах с разными версиями системы (XP/32, Win7/32, Win7/64) никаких проблем не возникло. А вот с линуксом все плохо. У меня интернет-проект, который обслуживается десятком Debian-серверов, нагрузка неравномерная и в среднем не менее 80% ресурсов этих машин можно было бы отдать на благое дело. Но не тут то было, только на двух из них клиент заработал сразу.

Клиент для Debian-based распространяется в виде бинарного deb-пакета, исходников нет. Проблема возникла с версиями динамических библиотек. Вот все, что касается проблемного сервера:

Код

# /etc/init.d/FAHClient start
Starting fahclient ... FAIL
# FAHClient
FAHClient: /usr/lib/libstdc++.so.6: version 'GLIBCXX_3.4.11' not found (required by FAHClient)
# apt-get install libstdc++6
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
libstdc++6 is already the newest version.
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 89 not upgraded.
# apt-get install libstdc++5
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
libstdc++5 is already the newest version.
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 89 not upgraded.
# uname -a
Linux Debian-50-lenny-64-minimal 2.6.26-2-amd64 #1 SMP Wed Aug 19 22:33:18 UTC 2009 x86_64 GNU/Linux

На старую версию дебиана не пенять, вот один из двух серверов, на котором все работает:

Код

# uname -a
Linux Debian-40-etch-64-minimal 2.6.18-6-amd64 #1 SMP Fri Jun 6 05:24:08 UTC 2008 x86_64 GNU/Linux

Второй "рабочий" сервер -- совсем свежий Squeeze.

Ну что, товарищи линуксоиды, готовы поддержать идеологию свободы и взаимопомощи? Или только халява -- ваш бог?

@activnaya · 16.04.2013, 21:56

интересно как Вы справляетесь с 10 серверами если элементарно "загуглить" так проблематично. Что ж, зделаю это за Вас.
http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=88&t=23934

magirus · 16.04.2013, 22:18

а сцылочко то битое...
и к тому же ссылки на сторонние форумы запрещены правилами....

@activnaya · 16.04.2013, 22:50

вбиваем в поиск "version 'GLIBCXX_3.4.11' not found (required by FAHClient)" и видим подробное решение проблемы на форуме сего же проекта. Сохранила вебстраничку, но не нашла как прилепить файл к посту.

@korvin_ · 17.04.2013, 07:05

А мне интересно, почему Стенфордский Университет не выложил исходники.

Добавлено через 9 минут
Кстати, если не ошибаюсь, для RPM-based дистрибутивов сейчас не проблема держать несколько версий одной и той же библиотеки.

quwy · 17.04.2013, 18:04 **[ТС]**

Сообщение от activnaya

интересно как Вы справляетесь с 10 серверами если элементарно "загуглить" так проблематично.

Потому что на этих серверах работает преимущественно мой собственный софт и гуглить просто нечего.

Что ж, зделаю это за Вас.
http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=88&t=23934

Идея подмены динамических библиотек лежит на поверхности. Проблема в том, что они имеют тенденцию тянуть за собой кучу зависимостей и этот квест может стать бесконечным. Хотя ссылка полезная, из нее я узнал о LD_LIBRARY_PATH и клиент таки подтянул .so из из другого каталога (но по ссылке неправильно линк делается, нужно libstdc++.so.6 вместо libstdc++.so). И мне повезло, что у меня есть рабочие системы и было откуда взять гарантированно правильные версии библиотек.

Сообщение от magirus

а сцылочко то битое...

Не, это форумный парсер ссылок слишком "умный".

Сообщение от korvin_

А мне интересно, почему Стенфордский Университет не выложил исходники.

Мне тоже интересно, особенно в ключе того, что мне нужно было запустить эту фигню еще на одной машине, на которой стоит Gentoo (это бекап-сервер в другом датацентре, которому сам бог велел поработать не только мышцами, но и головой). Это была вообще песТня!

И все-таки показательна разница в сложности благотворительности из-под винды и из-под линукса...

@activnaya · 17.04.2013, 18:19

Я так и не поняла. Клиент поднять удалось или нет?

>И все-таки показательна разница в сложности благотворительности из-под винды и из-под линукса...

Не стоит. Есть умение и (главное) желание читать документацию -- вперед. Мне кажется что Вы слишком уж натягиваете маску проблемы на довольно простые вещи.

quwy · 17.04.2013, 18:35 **[ТС]**

Сообщение от activnaya

Я так и не поняла. Клиент поднять удалось или нет?

Удалось, благодарю.

Мне кажется что Вы слишком уж натягиваете маску проблемы на довольно простые вещи.

Ну как же, я в этой ситуации наблюдаю проблему, которая похуже виндового dll hell будет.

@mokojumbot · 17.04.2013, 19:19

http://packages.debian.org/sea... ection=all

quwy Native x86 5596 / 3340 / 951 Регистрация: 13.02.2013 Сообщений: 10,587
		1
	Folding@Home: Windows vs Linux 16.04.2013, 21:20. Показов 1118. Ответов 8 Метки нет (Все метки) Я вскользь писал о сабже в холиварную тему, однако тамошних линуксоидов вопрос не заинтересовал совершенно, но проблему надо решать. Для начала, Folding@Home -- это бесплатная добровольная сеть распределенных вычислений (ботнет, если хотите), организованная Стенфордским Университетом. Самая мощная из всех подобных проектов на данный момент. Мощность сети используется для моделирования свертывания молекул белков, что в перспективе позволит понять причины возникновения и найти способы лечения целого ряда болезней. От диабета до рака. Работа клиента ведется на наинизшем приоритете, памяти он потребляет мало, поэтому на производительность компьютера его работа никак не влияет. С помощью сторонних программ можно запускать клиент только ночью, или при блокировке рабочего стола. В идеале участие в сети крайне простое: скачал инсталлятор, установил, и через пару минут твоя машина -- часть суперкомпьютера, работающего на благо человечества. В среде Windows это именно так и есть: на четырех доступных мне windows-компьютерах с разными версиями системы (XP/32, Win7/32, Win7/64) никаких проблем не возникло. А вот с линуксом все плохо. У меня интернет-проект, который обслуживается десятком Debian-серверов, нагрузка неравномерная и в среднем не менее 80% ресурсов этих машин можно было бы отдать на благое дело. Но не тут то было, только на двух из них клиент заработал сразу. Клиент для Debian-based распространяется в виде бинарного deb-пакета, исходников нет. Проблема возникла с версиями динамических библиотек. Вот все, что касается проблемного сервера: Код # /etc/init.d/FAHClient start Starting fahclient ... FAIL # FAHClient FAHClient: /usr/lib/libstdc++.so.6: version 'GLIBCXX_3.4.11' not found (required by FAHClient) # apt-get install libstdc++6 Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done libstdc++6 is already the newest version. 0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 89 not upgraded. # apt-get install libstdc++5 Reading package lists... Done Building dependency tree Reading state information... Done libstdc++5 is already the newest version. 0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 89 not upgraded. # uname -a Linux Debian-50-lenny-64-minimal 2.6.26-2-amd64 #1 SMP Wed Aug 19 22:33:18 UTC 2009 x86_64 GNU/Linux На старую версию дебиана не пенять, вот один из двух серверов, на котором все работает: Код # uname -a Linux Debian-40-etch-64-minimal 2.6.18-6-amd64 #1 SMP Fri Jun 6 05:24:08 UTC 2008 x86_64 GNU/Linux Второй "рабочий" сервер -- совсем свежий Squeeze. Ну что, товарищи линуксоиды, готовы поддержать идеологию свободы и взаимопомощи? Или только халява -- ваш бог? 0

@activnaya 256 / 46 / 4 Регистрация: 24.11.2012 Сообщений: 466
	16.04.2013, 21:56	2
	интересно как Вы справляетесь с 10 серверами если элементарно "загуглить" так проблематично. Что ж, зделаю это за Вас. http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=88&t=23934 0

magirus Почетный модератор 28046 / 15779 / 983 Регистрация: 15.09.2009 Сообщений: 67,752 Записей в блоге: 78
	16.04.2013, 22:18	3
	а сцылочко то битое... и к тому же ссылки на сторонние форумы запрещены правилами.... 0

@activnaya 256 / 46 / 4 Регистрация: 24.11.2012 Сообщений: 466
	16.04.2013, 22:50	4
	вбиваем в поиск "version 'GLIBCXX_3.4.11' not found (required by FAHClient)" и видим подробное решение проблемы на форуме сего же проекта. Сохранила вебстраничку, но не нашла как прилепить файл к посту. 0

@korvin_ 4539 / 2732 / 486 Регистрация: 28.04.2012 Сообщений: 8,630
	17.04.2013, 07:05	5
	А мне интересно, почему Стенфордский Университет не выложил исходники. Добавлено через 9 минут Кстати, если не ошибаюсь, для RPM-based дистрибутивов сейчас не проблема держать несколько версий одной и той же библиотеки. 0

quwy Native x86 5596 / 3340 / 951 Регистрация: 13.02.2013 Сообщений: 10,587
	17.04.2013, 18:04 [ТС]	6
	Сообщение от activnaya интересно как Вы справляетесь с 10 серверами если элементарно "загуглить" так проблематично. Потому что на этих серверах работает преимущественно мой собственный софт и гуглить просто нечего. Что ж, зделаю это за Вас. http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=88&t=23934 Идея подмены динамических библиотек лежит на поверхности. Проблема в том, что они имеют тенденцию тянуть за собой кучу зависимостей и этот квест может стать бесконечным. Хотя ссылка полезная, из нее я узнал о LD_LIBRARY_PATH и клиент таки подтянул .so из из другого каталога (но по ссылке неправильно линк делается, нужно libstdc++.so.6 вместо libstdc++.so). И мне повезло, что у меня есть рабочие системы и было откуда взять гарантированно правильные версии библиотек. Сообщение от magirus а сцылочко то битое... Не, это форумный парсер ссылок слишком "умный". Сообщение от korvin_ А мне интересно, почему Стенфордский Университет не выложил исходники. Мне тоже интересно, особенно в ключе того, что мне нужно было запустить эту фигню еще на одной машине, на которой стоит Gentoo (это бекап-сервер в другом датацентре, которому сам бог велел поработать не только мышцами, но и головой). Это была вообще песТня! И все-таки показательна разница в сложности благотворительности из-под винды и из-под линукса... 0

@activnaya 256 / 46 / 4 Регистрация: 24.11.2012 Сообщений: 466
	17.04.2013, 18:19	7
	Я так и не поняла. Клиент поднять удалось или нет? >И все-таки показательна разница в сложности благотворительности из-под винды и из-под линукса... Не стоит. Есть умение и (главное) желание читать документацию -- вперед. Мне кажется что Вы слишком уж натягиваете маску проблемы на довольно простые вещи. 0

quwy Native x86 5596 / 3340 / 951 Регистрация: 13.02.2013 Сообщений: 10,587
	17.04.2013, 18:35 [ТС]	8
	Сообщение от activnaya Я так и не поняла. Клиент поднять удалось или нет? Удалось, благодарю. Мне кажется что Вы слишком уж натягиваете маску проблемы на довольно простые вещи. Ну как же, я в этой ситуации наблюдаю проблему, которая похуже виндового dll hell будет. 0

@mokojumbot 160 / 160 / 30 Регистрация: 09.11.2012 Сообщений: 1,008
	17.04.2013, 19:19	9
	http://packages.debian.org/sea... ection=all 0